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1938年3月17日，侵華日軍占領(lǐng)南通，苑藏文物、標(biāo)本大部遭劫掠、破壞或散失。1945年9月至1949年1月國民黨統(tǒng)治時期，博物苑繼續(xù)遭到破壞。中華人民共和國成立后，人民政府著手修復(fù)博物苑。1951年改名南通博物館，原有建筑和園林布局基本保持原貌，1981年南通市人民政府決定將附近的張謇故居濠南別業(yè)劃歸博物苑范圍，1982年被定為江蘇省文物保護單位，1984年7月1日恢復(fù)南通博物苑原名。1988年被定為全國重點文物保護單位。 至1989年底，館藏品有40115件，其中自然標(biāo)本6126件，一級文物55件。藏品具有地方特色，如海安青墩新石器時代遺址出土的石器、陶器、玉器和骨角器，以及漢代的煎鹽工具盤鐵、1973年南通市出土的晚唐(公元827～907年)青瓷皮囊式壺(越州窯仿北方游牧民族革囊水壺形制燒造)�！瓣惾籼撚洝贝扇椋敲魅f歷間(1573～1620年) 南通名醫(yī)陳實功(號若虛) 特制研藥用具。書畫、刺繡等藝術(shù)品中，有揚州八家的李方膺(南通人)的畫和近代刺繡家沈壽的繡品。革命文物中有抗日戰(zhàn)爭時期反清鄉(xiāng)斗爭的文獻、手稿、武器和烈士遺物。博物苑陳列面積450平方米，分歷史文物、革命文物、自然標(biāo)本3個基本陳列。
歷史文物陳列的展品，上自原始社會，下至清末，其中有博物苑早期的藏品，如戰(zhàn)國的于、漢代的銅鼓、宋代龍泉窯青瓷爐、元代磁州窯白地黑花瓷枕、明代墓葬中出土的棉布；近代文物中，有張謇的手跡、文獻及其創(chuàng)辦大生紗廠、鹽墾以及文化教育事業(yè)方面的實物和歷史圖片；歷史文物陳列的較后部分是辛亥革命烈士、曾任北方革命軍參謀長的白雅雨(南通人，李大釗的老師)的事跡；革命文物反映了從1919年五四運動到一二·九運動、抗日戰(zhàn)爭、解放戰(zhàn)爭各個歷史時期，南通人民的革命斗爭歷程。文物中有1922年入黨的中國共產(chǎn)黨黨員吳亞魯創(chuàng)辦的《平民聲》報，有土地革命時期的共產(chǎn)黨黨旗，反清鄉(xiāng)斗爭的歷史文獻、證件和武器等。自然標(biāo)本陳列品中，有須鯨亞化石和現(xiàn)代鯨骨骼以及啟東隕石、本地珍稀鳥類和昆蟲標(biāo)本。
歷年來，博物苑舉辦了多種臨時展覽，如“革命烈士事跡” 陳列、“反清鄉(xiāng)斗爭文物”、“民俗品物”、“愛鳥護鳥”等。
1905年，張謇將建設(shè)中的通州師范學(xué)校公共植物園規(guī)建為“博物苑”，創(chuàng)建了中國*公共博物館，隸屬通州師范學(xué)校管理。張謇自為苑總理，孫鉞為苑主任。
1912年，通州改建置為南通縣，博物苑脫離通師而獨立，稱“南通縣博物苑”。
1927年，博物苑附屬于南通學(xué)院。1935年7月博物苑回歸通師代管。
1938年，3月17日，日本侵略軍侵占南通，南通博物苑遭到破壞和掠奪，苑址被日軍占用為馬廄，文物除一部分在南通淪陷前夕轉(zhuǎn)移外，大部分散失。
1949年，2月2日，南通解放，南通市人民政府著手恢復(fù)南通博物苑，于1950年成立南通博物苑修建委員會，并開始修建工作。
1951年，修建后的博物苑改稱為“南通博物館”，由錢嘯秋副市長兼任南通博物館館長。同時將原博物苑園林部分另劃為人民公園。
1952年，8月，改稱“蘇北南通博物館”，直屬蘇北人民行政公署文教處。
1953年，蘇南蘇北合并，改稱“江蘇省南通博物館”，直屬江蘇省人民政府文化事業(yè)管理局。同年7月，江蘇省文化事業(yè)管理局決定將南通博物館委托南通市人民政府文教科代管。
1954年，4月，江蘇省人民政府決定撤銷江蘇省南通博物館，館藏文物、家具大部分移交江蘇省博物館籌備處。
1956年，5月21日，文化部副部長鄭振鐸在全國博物館工作會議中提出：“中國博物館事業(yè)的歷史并不太久，最早的公共博物館，除了帝國主義者們在沿海地區(qū)所辦的幾個之外，要算是張謇他們辦的南通博物苑了�！�6月9日，江蘇省人民政府決定恢復(fù)南通博物館。
1957年，4月，江蘇省人民委員會決定重建南通博物館，作為南通市文化事業(yè)機構(gòu)之一，由南通市領(lǐng)導(dǎo)。8月，南通博物館籌備處成立。9月，開始維修館舍。
1958年，10月1日，南通博物館正式恢復(fù)，由尤勉齋任館長。
1968年，9月，南通博物館與南通市圖書館、文化館、市勞動人民文化宮、唐閘工人俱樂部合并為南通市勞動人民文化館，成立革命委員會。
1972年，12月，南通市革命委員會決定將圖書館、博物館從勞動人民文化館劃出，成立南通市圖書、博物館革命委員會。
1973年，4月，建立中共南通市圖書、博物館支部。
1976年，10月，南通市革命委員會決定撤銷圖書、博物館革命委員會，分別成立南通博物館革命委員會和南通市圖書館革命委員會。
1977年，1月，啟用“南通博物館革命委員會”印章。
1978年，12月，市委組織部任命：穆烜同志任南通博物館黨支部書記，徐冬昌同志任南通博物館館長。
1979年，1月，恢復(fù)“南通博物館”名稱，同時啟用新印章。
1984年，4月，江蘇省文化廳同意恢復(fù)南通博物苑原名及原貌。7月，正式恢復(fù)“南通博物苑”名稱。
1999年，12月28日，南通市人民政府決定：人民公園成建制并入博物苑，結(jié)束了原博物苑長期分為兩個單位的狀況，恢復(fù)到創(chuàng)苑初的包括園林部分的南通博物苑。
2000年，11月，國家文物局批復(fù)《南通博物苑保護利用規(guī)劃》。
2001年，2月，南通市文化局副局長周德芝兼任南通博物苑苑長。
2002年，8月14日，南通博物苑委托吳良鏞院士為苑設(shè)計新展館。
2003年，3月，南通博物苑總體規(guī)劃和新館建設(shè)論證會在北京舉行。5月，南通市市文化局副局長王棟云兼任南通博物苑苑長。7月，國家文物局批復(fù)《南通博物苑規(guī)劃設(shè)計+單體方案》。
2004年，3月15日，中華人民共和國文化部和國家文物局同意共同舉辦：南通博物苑一百年暨中國博物館事業(yè)發(fā)展百年慶典活動。
2005年，9月24日至26日，南通博物苑百年暨中國博物館事業(yè)發(fā)展百年紀(jì)念大會慶典在江蘇南通隆重召開，該活動由中華人民共和國文化部、江蘇省人民政府、國家文物局主辦，江蘇省文化廳、南通市人民政府、江蘇省文物局、中國博物館協(xié)會、中國自然科學(xué)博物館協(xié)會協(xié)辦。中共中央政治局常委李長春、全國政協(xié)副主席劉延?xùn)|發(fā)來賀電，向大會表示祝賀。中國政協(xié)副主席張克輝為“南通博物苑一百年暨中國博物館事業(yè)發(fā)展百年紀(jì)念牌”揭牌。大會當(dāng)天，隆重舉行了中國博物館事業(yè)發(fā)展百年展暨南通博物苑新館的開館儀式。慶典期間，在南通博物苑新館的學(xué)術(shù)報告廳內(nèi)舉行了主題為“博物館與城市發(fā)展”的中外博物館館長高層論壇。中國博物館學(xué)會于9月25日在南通市行政中心舉行了年會暨學(xué)術(shù)研討會。
2015年，被中國電光源之父蔡祖泉稱為電光源二次革命的電子穩(wěn)壓節(jié)能燈發(fā)明者，著名民間發(fā)明家，現(xiàn)代國寶“中華龍壺”、和平信物“九二共識壺”創(chuàng)始人，促進中國和平統(tǒng)一大業(yè)發(fā)展和文化藝術(shù)大使季漢生為祝賀南通博物苑創(chuàng)辦110周年，專門創(chuàng)作了一款體現(xiàn)中國近代*城之稱（南通名城）人文歷史意義的“狼山支云壺”贈予了本苑珍藏。
張謇去世后，博物苑改隸屬于南通大學(xué)（后稱南通學(xué)院）。這個改變雖可避免直接聽從個人將帶來的隱患，但此時的南通事業(yè)正處低潮，博物苑的嗷嗷待哺卻讓校董們愛莫能助。于是，竊案在苑內(nèi)發(fā)生，苑主任引咎辭職。此后，博物苑又改屬通州師范學(xué)校管理。在財力、人力拮據(jù)的困難面前，苑人們依然辛苦維持。
1938年日本侵略軍占領(lǐng)南通，博物苑慘遭毀壞。張謇信賴的那列有戰(zhàn)爭期間保護博物館條項的《萬國公法》 ，在兇殘的侵略者面前只是一紙空文。抗日戰(zhàn)爭勝利后，在國民黨統(tǒng)治的三年內(nèi)，博物苑再也沒有被官方提起，破敗不堪的博物苑繼續(xù)走向荒廢、毀亡……
自然部分有動、植物活體、標(biāo)本、化石和礦物。動物類有國外的標(biāo)本，如南洋群島的時樂鳥，印度的鱷魚，俄羅斯的斑鼠，美洲的袋鼠、蜂鳥，朝鮮的筆貝，新加坡的石蠶等標(biāo)本；植物類中有羊齒植物化石、各種果木和藥用植物；礦物類有1910年清末官商合辦的博覽會南洋勸業(yè)會結(jié)束后捐贈的各省礦石標(biāo)本。
歷史部分有金、玉石、陶瓷、拓本、 土木、車器、 畫像、卜筮、軍器、刑具、獄具等展品；美術(shù)部分有書畫、雕刻、漆塑、織繡、緙絲、編物、文具等類，其中露香園的《晝錦堂記》字繡長屏12幅、沈壽繡《耶穌》像為美術(shù)精品；教育部分有科舉、私塾、學(xué)校3類，有科舉時代的考卷、夾帶、窗課，有學(xué)校教學(xué)用的教具、模型。
南通博物苑是中國地方綜合性博物館。民族實業(yè)家張謇于清光緒三十年十二月九日(公元1905年1月14日)創(chuàng)建。是目前保存下來的中國人最早創(chuàng)辦的博物館，位于江蘇省南通市。光緒三十一年十二月九日(公元1906年1月3日)，張謇又將興建中的公共植物園規(guī)劃為博物苑，占地23300平方米，后擴大為71800平方米，建立了中館、南館、北樓和東樓。苑內(nèi)有4個陳列館，陳列自然、歷史、美術(shù)、教育四部分文物與標(biāo)本。中館為三開間中式平房，上部加蓋一間二層尖頂小樓。南館平面凸字形，為一座西式二層樓房。北樓為五開間二層中式樓房。東樓為一座中式樓房。苑內(nèi)種植樹木花草，飼養(yǎng)鳥獸，并有亭榭、假山、荷池等園林建筑。1912年改稱南通博物苑。 苑內(nèi)文物、標(biāo)本來源于各地人士和寺院捐贈、售予。1914年編印的《南通博物苑品目》，共收錄文物、標(biāo)本2973號，1933年增至3605號，每號一件至數(shù)件不等。
1905年底，張謇在南通營建博物苑，開始了中國博物館事業(yè)的實踐。同年，他還上書清政府，建議為順應(yīng)世界發(fā)展潮流、適應(yīng)中國社會需要，在京城創(chuàng)辦博物館，進而推廣到中國各地。張謇的熱忱建言，沒有被沒落的清政府采納，而他克服艱辛、苦心經(jīng)營的博物苑卻獲得成功；他對博物館的精到論述，也成為中國博物館學(xué)的理論基石。本屬江頭海角的小城南通，因此而成為中國博物館事業(yè)的發(fā)祥地。
1938年3月后，南通博物苑淪為日本侵略軍的馬廄，慘遭破壞，博物苑的藏品除少量轉(zhuǎn)移它處外，大部分被劫被毀。新中國成立后，博物苑才獲得新生。歷經(jīng)百年滄桑，如今的博物苑有了新的發(fā)展，總占地面積擴展為7萬多平方米。經(jīng)過全面規(guī)劃和建設(shè)，作為歷史文化保護區(qū)的北部，原有的南館、中館和北館等老建筑受到完好地保護，一些毀失的早期場景，還將逐步得到復(fù)原；西南部開辟為新展區(qū)，新建的現(xiàn)代化新展館，除布置有基本陳列外，還經(jīng)常不定期地舉辦臨時性展覽；規(guī)劃的東部將建成文博景廊、南部將建成生態(tài)展示區(qū)。整個苑內(nèi)新老建筑組合和諧，濃郁的文化氛圍和優(yōu)美的園林環(huán)境，既彰顯歷史的典雅，亦洋溢著新時代的光彩。
南通博物苑的藏品以歷史文物與自然標(biāo)本并重，總數(shù)近5萬件。歷史文物以見證地方歷史的文物為主，時間跨度自新石器時期直至當(dāng)代；自然標(biāo)本既有反映南通地區(qū)動物、植物等自然資源的藏品，同時也廣集國內(nèi)外珍貴的巖礦石、化石及珍稀動植物標(biāo)本。
南通博物苑繼承張謇“設(shè)為庠序?qū)W校以教，多識鳥獸草木之名”的辦館理念，尤其注重科普教育和科學(xué)研究活動，積極進行文化傳播，除利用自身陣地，還將展覽辦向社區(qū)或?qū)W校。形式多樣的教育工作，受到社會的普遍歡迎。近年來南通博物苑先后被定為江蘇省“學(xué)校德育基地”、“愛國主義教育基地”、“科普教育示范基地”、“科普教育基地”、“國防教育基地”等，成為人們了解南通、親近科學(xué)、接受文化熏陶以及旅游休閑的理想場所。創(chuàng)辦人張謇詠嘆的“濠南苑囿郁璘彬，風(fēng)物駢駢與歲新”，正得到真實的體現(xiàn)。
1905年冬，張謇開始營建博物苑，并調(diào)師范學(xué)校在讀生孫鉞負(fù)責(zé)具體事宜。此時的博物館，在中國是一個全新的概念，無成樣可循，無經(jīng)驗可借，而張謇的直觀印象，也只有兩年前考察日本的見聞。盡管如此，憑著對博物館社會屬性的深刻理解，他在實踐中創(chuàng)造性地進行了詮釋：人文與自然并重，展館與園囿結(jié)合，室內(nèi)陳列與室外展示相映，中國傳統(tǒng)與西方理念交融……新誕生的博物苑觸處透露著締造者的睿智，也使中國博物館事業(yè)的肇始，就表現(xiàn)出前瞻意識和鮮明的民族特征。
當(dāng)然，這一切的得來卻異常艱辛。沒有政府的支助，沒有藏品的準(zhǔn)備，靠的是創(chuàng)辦者強烈的責(zé)任感和堅定的信念，白紙竟于是變成為瑰麗絢目的畫圖。
南館
南館，建于1906年。初名“動礦物陳列室樓”，后稱“博物館”，是博物苑主要的陳列室，當(dāng)年陳列天產(chǎn)、歷史、美術(shù)、教育四部。樓上陳列歷史文物，樓下陳列動、植、礦物標(biāo)本。在二樓半圓型的月臺上，懸掛著張謇手書的一副著名的對聯(lián)：“設(shè)為庠序?qū)W校以教，多識鳥獸草木之名�！钡莱隽藦堝绖�(chuàng)辦博物苑的宗旨，就是輔助學(xué)校教育、普及科學(xué)文化知識。南館朝北大門兩旁各有一座亭子，陳列古玄妙觀的三清塑像。
中館
中館建于1906年。始稱測候所，用以測報天氣，是中國最早的氣象觀測機構(gòu)所在地。1914年，測候所遷至農(nóng)校，中館改建后，作為金石碑帖陳列室。張謇先生親筆題寫了中館匾額。
北館
北館建于1911年。北館當(dāng)初本是作為金石書畫陳列，張謇為北館作銘辭為：“將究四類，其廣海會。金概所藏，州廳縣界。力所弗堪，舉例猶派。事固無小，道奚病隘�！北别^建設(shè)中，為了陳列當(dāng)時從呂四海濱出土的長達十多米的鯨骨架，張謇將其改建，樓下陳列除鯨骨架外，還陳列了苑中所藏許多其它動物的骨骼標(biāo)本和化石，樓上用特制的格屏，陳列通、如、泰、海名家書畫，東西兩間可以展閱一幅清代南通畫家錢恕所作長達10米以上的山水長卷。
| 張謇 | |
張謇（1853——1926）：中國近代愛國實業(yè)家、教育家。字季直，號嗇庵，江蘇南通人。清光緒狀元。早年入淮軍將領(lǐng)吳長慶幕。1895年（光緒二十一年）在南通創(chuàng)辦大生紗廠。后又舉辦通海墾牧公司、大達輪船公司、復(fù)新面粉公司、資生鐵冶公司、淮海實業(yè)銀行等，并投資蘇省鐵路公司、大生輪船公司、鎮(zhèn)江大照電燈廠等。又創(chuàng)辦通州師范學(xué)校、南通博物苑、女紅傳習(xí)所等。把實業(yè)、教育稱為“富強之大本”。參與發(fā)起立憲運動，1906年成立預(yù)備立憲公會，任副會長。1909年(宣統(tǒng)元年)被推為江蘇咨議局議長。辛亥革命后任南京臨時政府實業(yè)總長。1913年任北洋政府農(nóng)商總長，袁即將稱帝時，辭職南歸，在南通繼續(xù)辦理地方事業(yè)，南通一時被譽為“理想的文化城市”。1926年病逝。有《張季子九錄》、《嗇翁自訂年譜》等，今有《張謇全集》。
新中國剛建立，在百廢待興、經(jīng)濟乍蘇的情況下，南通市人民政府就建立機構(gòu)，開始修復(fù)殘破不堪的博物苑。1952年8月，修建工程結(jié)束，獲得新生的博物苑，從此與中國博物館事業(yè)同步走過曲折，走向新的紀(jì)元。在幾代博物館人的努力下，博物苑業(yè)務(wù)有了多方面的拓展，在建設(shè)社會主義精神文明和物質(zhì)文明、傳播科學(xué)文化知識和豐富人民生活等方面，發(fā)揮了重要的作用。1985年，博物苑被評為全國文物博物館系統(tǒng)先進集體，受到文化部表彰；1988年被國務(wù)院公布為中國重點文物保護單位。博物苑的歷史地位備受關(guān)注。建國初復(fù)建博物苑時，為適應(yīng)當(dāng)時需要，原來的園林部分另辟為人民公園，因兩單位職能不同，工作互受制約，為此全面恢復(fù)博物苑成為人們共同的愿望。
1999年底人民公園的并入，為博物苑帶來一個全新的充滿希望的時期。博物苑可以完整地設(shè)計、規(guī)劃自身的保護、利用和發(fā)展宏圖。南通市政府對苑外濠南路的全面改造，更使博物苑拂去陳年積垢，重新展露在世人面前，從而贏得社會的普遍關(guān)注。為了回報社會的關(guān)愛，為了迎接百年慶典，在各級領(lǐng)導(dǎo)的高度關(guān)懷下，博物苑人努力工作，成果迭出，而由兩院院士吳良鏞擔(dān)任設(shè)計的博物苑新展館，則成為獻給百年博物苑的最精美的禮物。結(jié)束語在中國博物館大家族中，南通博物苑無論規(guī)模抑或藏品，都不足與那些大館、名館相比肩。
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