全國大學生“三下鄉”社會實踐先進團隊、全國“巾幗文明崗”、學校先后榮獲全國衛生系統先進單位、重慶市三八紅旗集體、重慶市職業技術教育先進集體、重慶市高等學校教學質量與教學改革工程先進單位、重慶市大中專畢業生就業工作先進集體、重慶市德育特色學校、“重慶市工人先鋒號”單位等稱號。學校獲得全國高職高專藥品(藥學)類專業建設成果優秀獎、國家“黃炎培優秀理論獎”和重慶市“黃炎培優秀學校獎”。“中國青愛工程十所標桿小屋”等稱號，重慶醫藥高等專科學校網站重慶市模范職工之家、榮獲重慶市文明單位、全國教科文衛體系統先進工會組織、重慶市依法治校示范學校、全國五四紅旗團委、全國女職工培訓示范學校。
醫療美容技術、醫學檢驗技術、臨床醫學、有全日制普通大專學生10000余人 .學校開設有藥學、生物制藥技術、中醫學、藥物制劑技術、中藥制藥技術、重慶醫藥高等專科學校官網 www.cqyygz.com 藥劑設備制造與維護、藥品經營與管理、藥品質量檢測技術、中藥、衛生檢驗與檢疫技術、食品營養與檢測、醫用電子儀器與維護、針灸推拿、眼視光技術、醫學影像技術、醫學影像設備管理與維護等22個大專專業和4個專業方向，形成了全日制教育、成人教育、繼續教育等多層次辦學格局。護理、重慶醫藥高等專科學校網站康復治療技術、助產、學校面向全國17個省市招生。
醫療衛生機構和醫藥企業，學校堅持“校企院合作、聯合全國160余家知名職業院校、集團化辦學”模式，牽頭成立了重慶醫藥職業教育集團。依托職教集團，成立了校院企深度合作的“太極學院”、“邁克學院”、“憶念美學院”、“寬仁康復學院”。有近三分之一的畢業生在集團內就業。學校有中央財政支持的國家級藥物制劑技術高等職業教育實訓基地和護理高等職業教育實訓基地、有地方財政支持的生物制藥技術高等職業教育實訓基地;有重慶市高職高專院校中首家工程技術研究中心、重慶高校中首家模擬GMP藥學實訓工廠。有重慶市醫學檢驗試劑研究所等獨立設置的研究機構;有11所非直管附屬醫院、14所教學醫院及大中型制藥廠、醫藥公司、醫院等校外實習基地100多個。近三年畢業生平均就業率95%以上，學生職業資格考試通過率、雙證獲得率97%以上，專業對口率96.%以上。2013年，重慶市教育評估院公布了全市39所高職高專院校就業相關情況第三方評估數據，學校綜合評價名列全市高職高專院校第一。
高校云集、學校位于文化氛圍濃郁的重慶大學城，碧水常流，這里青山常翠、英才薈萃，這里資源共享、教師互聘、學分互認、課程互選、信息互通。新型的教育城、人才城、科技城、生態城為重慶醫藥高等專科學校提供了得天獨厚的發展空間。
懿德善能”的校訓，學校秉承“以生為本，弘揚“篤學求真，立德樹人”的辦學理念，發揚“求同存異，齊心協力”的團隊精神、“知難而進，追求卓越”的進取精神、“負重自強，艱苦奮斗”的創業精神、“甘于奉獻、勇于擔當”的敬業精神、“救死扶傷、精益求精”的職業精神，遵循“弘德善教，愛生律己”的優良教風和“修德勤學，尊師守紀”的優良學風，緊貼重慶和西部地區基層醫療衛生事業、藥品生產經營行業、健康相關產業發展需要，培養具有良好醫藥人文素養的高素質技術技能型專門人才。學校重點辦好專科層次職業教育，積極發展繼續教育，以藥學、護理、醫學檢驗技術、臨床醫學和中醫專業為龍頭，帶動中藥、康復、醫電、美容等相關專業發展，努力建設成為主干專業優勢突出、行業特色鮮明，西部領先、國內知名的醫藥高等職業院校。
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