設有山東大學博士、碩士學位授予點，山東第一醫科大學碩士學位授予點，一個博士后科研工作站、兩個院士工作站，20個國家、省級培訓基地，19個國家、省、市級技術指導中心，21個國家、省、市重點學科重點專業重點實驗室；是中國醫師協會兒科醫師分會副會長單位，中國醫師協會兒科分會感染、呼吸內鏡專業委員會等四個專業委員會主任委員單位。
呼吸內科、神經內科、新生兒科、小兒心血管科已成為省內知名品牌。呼吸介入、微創外、血液腫瘤、神經外、介入醫學、腦癱康復、兒童保健等在全國具有較高知名度。內科設有呼吸、呼吸介入、消化、心血管、神經、腎臟、血液、風濕免疫、內分泌、遺傳、新生兒、感染、重癥醫學等專業；建立了急診、PICU、NICU、CCU的院內急救體系和覆蓋全省的院前轉運網絡。外科設有骨外、普外、胸外、心外、泌尿外、神經外、新生兒外、整形燒傷外等專業。
在各級政府和社會各界的大力支持和關心下，醫院始終把實現好、維護好、發展好人民健康權益，保證兒童身心健康，作為醫院改革發展的出發點和落腳點，從質量、安全、服務和兒童健康需求入手，著力構建現代化醫院發展的“七個體系”：學科體系、科教體系、管理體系、服務體系、文化體系、信息化體系、保障體系。
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