19個碩士專業學位授權點。34個一級學科碩士學位授權點，現有21個一級學科博士學位授權點，福建師范大學研究生院，已培養了近27000名碩士研究生和1200余名博士研究生。其中博士生近800人，福建師范大學研究生院現有在校研究生近8000人，碩士生7200余人。
1981年被國務院學位委員會批準為碩士學位授予單位，2003年成立研究生教育學院，2005年設立研究生工作部，學校于1984年成立研究生科，福建師范大學的研究生教育，1978年恢復招收研究生，可以追溯到20世紀60年代，福建師范大學研究生院，1993年被批準為博士學位授予單位。2012年成立福建師范大學研究生院。1993年成立研究生處。
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