2006年擴建新館，目前館舍面積為16800平方米。2006年開始引進碩士畢業生，現有博士研究生1人，碩士研究生及同等學歷36人，包括圖書情報學、計算機、數學、漢語言文學、歷史學，同時還有藥學、公共衛生、中醫、針灸、麻醉、護理等專業的工作人員。1998年與原新疆中醫學院圖書館合并，成立了新疆醫科大學圖書館。新疆醫科大學圖書館現有在職人員61人，其中正高職稱1人，副高職稱9人，中級職稱23人。新疆醫科大學圖書館的前身是始建于1956年的原新疆醫學院圖書館。
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