藥學院、檢驗學院、公共衛生學院、人文與管理學院、麻醉學院、法醫學院、護理學院、醫學信息學院、公共基礎學院（創新創業學院）、基礎醫學院、馬克思主義學院、研究生學院、繼續教育學院等16 個二級學院。口腔醫學院、皖南醫學院設有臨床醫學院、醫學影像學院。
法6 個學科門類，皖南醫學院，涵蓋醫、學校現有本科專業28個、管、工、經、其中專任教師1393人，理、教職醫護員工4840余人（含直屬附院），專科專業2個，高級職稱798人。現有各類在校生2.6萬余人，其中本科生15790人，專科生352人，研究生973人，成教學生9000余人。
始建于1958年，皖南醫學院，地處安徽蕪湖市，皖南醫學院現有銀湖校區、濱江校區、赭麓校區三個校區，占地700余畝，各類建筑40余萬平方米。皖南醫學院已形成以醫學為主、多學科協調發展、布局合理、特色鮮明的多層次辦學格局。
皖南醫學院的前身為為蕪湖醫學專科學校，1971年并入安徽醫學院，為安徽醫學院皖南分院，1974年經國務院批準獨立建校，命名為皖南醫學院。1981年學校獲得國務院學位委員會學士學位和碩士學位授予權；1998年一次性通過教育部本科教學工作合格評價。
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