研究院設(shè)有法醫(yī)病理學、法醫(yī)臨床學、法醫(yī)精神病學、法醫(yī)物證學、法醫(yī)毒物化學、微量物證學、文件鑒定學、聲像鑒定學、痕跡鑒定學、電子數(shù)據(jù)鑒定、道路交通事故技術(shù)鑒定、環(huán)境損害司法鑒定、司法鑒定制度與法規(guī)等專業(yè)。辦有中文核心期刊《中國司法鑒定》和《法醫(yī)學雜志》，英文期刊Forensic Sciences Research。
研究院是通過實驗室認可、檢查機構(gòu)認可、能力驗證提供者認可以及國家級實驗室/檢查機構(gòu)資質(zhì)認定“五合一”評審的司法鑒定機構(gòu)，在我國司法鑒定事業(yè)中發(fā)揮了重要的示范、引領(lǐng)和推動作用。在“以科學捍衛(wèi)公正”核心價值理念引領(lǐng)下，分別確立了“嚴謹求是、科學規(guī)范、獨立客觀、準確公正”和“嚴謹求是、科學規(guī)范、客觀公正、專業(yè)高效”的質(zhì)量方針，確保以公正的行為、規(guī)范的程序、科學的方法、正確的結(jié)論，為司法實踐和行業(yè)發(fā)展服務(wù)。研究院按照《檢驗檢測機構(gòu)資質(zhì)認定能力評價 檢驗檢測機構(gòu)通用要求RB/T214-2017》《檢驗檢測機構(gòu)資質(zhì)認定能力評價 司法鑒定機構(gòu)要求RB/T219-2017》以及《司法鑒定/法庭科學機構(gòu)認可指南CNAS-CL08:2013》建立了司法鑒定管理體系。按照CNAS-CL03:2010《能力驗證提供者認可準則》（ISO/IEC17043:2010）建立了能力驗證管理體系。
享受國務(wù)院特殊津貼10人。儀器裝備已達到國際先進水平。司法鑒定科學研究院執(zhí)行中央編辦、司法部賦予的承擔“司法鑒定領(lǐng)域的基礎(chǔ)研究、應(yīng)用研究和高新技術(shù)研究；全國重大疑難案件的司法鑒定和技術(shù)指導(dǎo)；司法鑒定高端人才的培養(yǎng)培訓(xùn)；國內(nèi)外學術(shù)交流等工作”職能。目前有職工224人，其中黨員106人，專業(yè)技術(shù)人員占78%，高級專業(yè)技術(shù)人員占專業(yè)技術(shù)人員總數(shù)的60%。
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