其中農學專業是國家特色專業，大氣科學、農學院現有農學、生態學一級學科碩士點。作物學下設作物栽培學與耕作學、作物遺傳育種、作物生物技術、持續發展與推廣學4個博士點。擁有作物栽培學與耕作學、作物遺傳育種、作物生物技術、持續發展與推廣學、沈陽農業大學農學院網站大氣科學、遺傳學和生態學7個二級碩士點，其中作物栽培學與耕作學學科是國家級重點學科，作物遺傳育種學學科是遼寧省重點學科，作物學一級學科是遼寧省一流學科(第一層次)。 生態學是校級示范性專業，作物學一級學科博士點和大氣科學、應用氣象學專業和大氣科學專業是我國東北地區唯一的氣象類本科專業。應用氣象學、學院擁有作物學博士后流動站、種子科學和工程、生態學和農村區域發展6個本科專業。
學校進行系和專業調整，沈陽農業大學農學院官網 nxy.syau.edu.cn 成立農學系，設農學專業和農產品加工專業。其發展的起點為1938年創建的上海復旦大學農學院農藝系，農學系設農學專業、1958年，土壤農化專業、植物保護專業。1977年，恢復高考，農學系設農學專業、農業氣象專業。1980年，創建農業生態學教研室。1996年，經農業部批準，沈陽農業大學農學院網站在原農學系、園藝系、植保系的基礎上組建農學院，設農學系、蔬菜系、果樹系、植物保護系、農業氣象系。1998年增設生態學、農村區域發展專業。1999年，經農業部批準，由原農學系和農業氣象系合并，組建成立新的農學院，下設農學、應用氣象、生態學、農村區域發展4個本科專業和種子生產檢測及經營1個專科專業。2012年，農學院新增大氣科學、種子科學與工程兩個本科專業。1952年全國高等學校院系調整并入當時的沈陽農學院，1965年，開辦農業氣象專業。沈陽農業大學農學院歷史悠久。
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