下設數字海洋研究所、海洋漁業遙感GIS技術實驗室、海洋藥物與健康食品研究所、海洋生態系統與環境實驗室、學校建有上海海洋大學海洋科學研究院，海洋文化研究中心等研究機構。海洋政策與法律研究所，建有外國語言研究所、海洋藥物系統及神經科學研究所、中國魚文化研究所、鯨館、水生生物科技館、校史館、三史館、大學生校園文化展示館，擁有國內外聞名的魚類研究室、標本室。上海海洋大學網站擁有現代化的校園網絡，建有服務我國水產行業的中國水產網。學校圖書館現有紙質圖書約132萬余冊，電子圖書約88萬余冊，數據庫40余個，館藏資源突出學校的海洋、水產、食品特色。由學校承辦的《水產學報》、主辦的《上海海洋大學學報》被列為中文核心期刊、中國科技核心期刊和中國科技論文統計源期刊，《水產學報》獲 “百種中國杰出學術期刊”稱號。學校是上海市水產學會、上海海洋大學官網 www.shfu.edu.cn 上海市食品學會、上海市漁業經濟研究會和上海市延安精神研究會掛靠單位。中美海洋遙感及漁業信息研究中心。
學校原為農業部部屬高校，1985年更名為上海水產大學，以上海市管理為主。上海海洋大學前身是建于1912年的江蘇省立水產學校，2008年經教育部批準更名為上海海洋大學。由中央和地方共建，學校校訓：勤樸忠實。2000年起由農業部劃轉地方，上海市人民政府與國家農業部聯合發文共建上海海洋大學。1952年成為國內第一所本科水產高�！虾Ｋa學院，2010年上海市人民政府與國家海洋局簽署協議共建上海海洋大學;2011年。
其中教學科研人員近900名，全日制普通本專科生12300余人、學校目前共有12個學院(部)，上海海洋大學網站具有高級專業技術職務500余名，博士生、碩士生導師600余名。學校擁有雙聘院士2名、第一批“長江學者獎勵計劃”特聘教授1名、國家“千人計劃”3名、國家“青年千人計劃”1名、國家杰出青年科學基金獲得者1名、百千萬工程國家級人才4名、國務院學科評議組成員(第七屆)2名、國務院政府特貼人員11名、科技部中青年科技創新領軍人才1名、教育部新世紀人才2名、省級有突出貢獻專家2名、上�！扒擞媱潯�5名、上海市領軍人才5名、上海市優秀學科帶頭人6名、上海市優秀技術帶頭人1名、省市級教學名師3名、“百千萬人才工程”(省級)2名、一級學會會長3名等，擁有上海市東方學者18名、青年東方學者2名、上海曙光學者15名、上海浦江計劃19名、上�？萍紗⒚餍�10名、陽光學者6名、晨光計劃7名等為骨干的師資隊伍。研究生3050余人;教職工1200余名。
2010年起連續多年被評為全國高校“百佳網站”以及“最佳思政創新獎”、學校易班先后獲得全國高校校園文化建設優秀成果特等獎、作為上海高校首批易班試點單位，“最佳文明網絡社區獎”等單項獎，并多次榮獲“上海市教育系統優秀網站”、教育部中國大學生在線優秀校園網絡通訊站、上海市十佳易班學生工作站等稱號。學校校園文化豐富多彩，聘請著名表演藝術家秦怡、指揮家曹丁、作曲家陳鋼等一批藝術家為學校藝術兼職教授;擁有大學生藝術團等各類文體、科技學生社團90余個;定期舉辦大學生科技文化藝術節，連續多年被中宣部、教育部、團中央、全國學聯評為“大學生暑期社會實踐先進單位”。上海市教育改革實驗獎一等獎。
澳大利亞、日本、學校與美國、韓國等國家和臺灣、香港地區的大學和國際組織有著密切的交流與合作，與23個國家的79個學校或科研機構簽署合作協議。與境外多所大學互派留學生，目前學校各類留學生人數共計126人，分別來自20個國家。學校長期參與中美海洋生物資源合作計劃，與聯合國糧農組織、亞洲水產學會、國際水生生物資源管理中心等建立了長期友好合作關系。俄羅斯。
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