現有博導669名，大師云集、中國工程院院士13人，醫學院堅決貫徹“人才強院”的主戰略，人才薈萃。其中包括中國科學院院士2人，美國科學院外籍院士1人，法國科學院外籍院士2人，美國醫學科學院外籍院士2人，英國皇家內科醫師學院院士1人，法國國家醫學科學院院士1人，國際牙醫學院院士1人，中組部“千人計劃”9人，“青年千人”10人，上海交通大學醫學院研究生院網站國家“973”項目首席科學家11人次，長江學者特聘教授和講座教授24人，國家杰出青年基金獲得者23人。國家級教學團隊1個，國家級教學名師1人，上海市教學團隊5個，上海市教學名師8人。國家級大學生校外實踐基地3個，國家級實驗教學示范中心1個，2010年，我院王振義院士榮獲國家最高科技獎。碩導1173名。歐洲科學院外籍院士1人，上海交通大學醫學院研究生院官網 yjsy.shsmu.edu.cn 切實加強高層次人才隊伍建設，第三世界科學院院士2人。
充分利用國家留學基金委、聘請200余位國外專家作為學院的名譽教授、積極推動研究生教育的國際化。顧問教授和客座教授。醫學院注重對外交流，醫學院國(境)外訪學項目22人，目前已與19個國家和地區的63所大學及科研機構開展了廣泛的合作，各類出國會議次數75次，上海交通大學等多種渠道，海外游學項目28人。 醫學院研究生院2015年開展的國家公派研究生項目38人。
1997年，學校通過了“211工程”立項。2005年7月18日，上海交通大學醫學院研究生院網站上海交通大學與上海第二醫科大學合并，成立了由教育部、上海市政府重點共建的上海交通大學醫學院，進入“985”高校行列。2010年11月，學院成為衛生部與教育部合作共建的第一批十個重點高校中的一員。震旦大學醫學院(1911-1952)、1985年更名為上海第二醫科大學。上海交通大學醫學院前身是由圣約翰大學醫學院(1896-1952)、同德醫學院(1918-1952)于1952年全國高等學校院系調整時合并而成的上海第二醫學院。
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