醫院對口幫扶含山縣人民醫院、和縣人民醫院，托管沙塘街道社區衛生服務中心；管理姑山社區衛生服務中心。2022年4月，市臨床檢驗中心正式調整為醫院隸屬的二級單位。醫院全面托管二級醫療機構博望區人民醫院，同時掛牌馬鞍山市人民醫院博望分院，全面構建市-區緊密型醫聯體。
馬鞍山市人民醫院始建于1958年，坐落在風景秀麗的雨山湖畔，是一所集醫療、科研、教學、保健、急救、康復等為一體的三級甲等綜合性醫院，是本市患者就診量最大、硬件設備最先進、綜合服務能力最強的政府舉辦的公立醫院。
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