物理實驗中心等5個教學行政單位，物理系、影像信息工程技術研究中心、學院下設綜合辦公室、地理信息系統教研室、復雜系統研究中心、以及數學與系統科學研究所、數學系、城市與區域發展研究所等4個研究機構。
秉承“誠毅”校訓，努力創建特色學科，積極開展教學研究，取得了豐碩的研究成果。學院始終弘揚嘉庚精神、福建省教學成果獎一等獎一項，集美大學理學院網站精心打造精品課程，“高等數學”和“大學物理”為福建省精品課程，認真貫徹學校辦學指導思想，“高等代數”為福建省精品立項課程，“應用數學”為校級重點學科。榮獲國家級教學成果獎二等獎一項。
在校本科學生1385人。其辦學歷史可追溯到1918年愛國華僑陳嘉庚先生創辦的集美師范學校，迄今已為國家培養了近萬名數學、物理和地理學科的高級專門人才。信息與計算科學、光信息科學與技術以及地理信息系統五個本科專業和一個應用數學碩士點，集美大學理學院現有數學與應用數學、應用物理學。
福建省高校服務海西重點項目、集美大學理學院官網 sci.jmu.edu.cn 福建省高校優秀人才支持計劃項目、福建省自然科學基金項目、福建省青年創新基金項目等科研課題80多項，已在《Information Sciences》、《Physical Review Letter》、《Physics Review E》、《Fuzzy Sets and Systems》、《Proc. Amer. Math. Soc.》、《中國科學》、《數學學報》、《物理學報》等國內外近百種學術刊物上發表論文600多篇，其中已被國際權威檢索刊物《SCI》、《EI》和《ISTP》收錄200多篇，榮獲福建省科學技術一等獎1項，各種級別的優秀學術論文獎98篇。集美大學理學院網站學科建設與科研經費達到2000萬元。 學院承擔了國家973重大項目、國家自然科學基金項目、近年來，中科院創新工程項目。
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