2006年，南海校區(qū)與華南師范大學用統(tǒng)一招生代碼招生。
大學城校區(qū)、華南師范大學第十三次黨代會明確把南海學院定位為學校三校區(qū)(石牌校區(qū)、2004年6月，廣東省政府、進行校區(qū)第一輪改革。廣東省教育廳在辦學性質(zhì)上明確界定南海校區(qū)為公辦性質(zhì)的學校。南海校區(qū))之一進行建設(shè)，同年9月。
南海學院開始招收第二批本科層次的學生。2003年。
根據(jù)一校三區(qū)協(xié)調(diào)發(fā)展的總體布局，強化特色、國際合作、服務地方”的總體要求，在南海校區(qū)新組建四個本科學院，華師南海學院網(wǎng)站分別是國際商學院、城市文化學院、軟件學院和職業(yè)教育學院;同時，保留南海學院至2016年最后一屆專科學生畢業(yè);本著“精簡、務實、高效”的原則，按照“學校職能部處直線指揮為主，校區(qū)屬地管理主要負責協(xié)調(diào)”的要求，重新設(shè)置南海校區(qū)的組織架構(gòu)，設(shè)立南海校區(qū)管理委員會、成立綜合管理辦公室、人事管理辦公室、教學管理辦公室、華師南海學院官網(wǎng) nh.scnu.edu.cn 學生工作辦公室、財務管理辦公室、科研管理辦公室、安防保衛(wèi)辦公室、后勤管理辦公室等八個職能辦公室。按照“創(chuàng)新管理、學校正式啟動南海校區(qū)第二輪綜合改革。2013年4月12日。
文化產(chǎn)業(yè)管理、文秘、金融與證券、會計電算化、應用英語、電子商務、計算機網(wǎng)絡(luò)、數(shù)字媒體設(shè)計與制作、華師南海學院網(wǎng)站客戶服務管理等9個專科專業(yè)，從2014年起都停止招生。軟件工程和教育學(職教師資)等5個本科專業(yè);還有法律事務、法語、南海校區(qū)現(xiàn)設(shè)有財務管理。
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