學校下轄多個校區,武漢市硚口區為校本部,是主要的教學訓練和科研場所;武漢市江夏區藏龍島校區,是科研試驗場所;武漢市黃陂區木蘭湖校區,是軍事基礎訓練、海軍職業素養培養和部分科研試驗場所;湖北省紅安縣革命傳統教育基地,是主要的革命傳統教育和野外綜合訓練場地。學校堅持以本科教育與研究生教育為主體,學歷教育與任職培訓相結合。海軍工程大學創辦于1949年11月,1963年被確定為全國重點大學。
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