圖書館目前現有正式職工32人，其中黨政人員占9％，業務人員等占91％；高級職稱4人、中級12人、初級以下16人；碩士15人、本科12人、大專以下5人，本科以上占84%。目前內部管理機構設有辦公室、采訪編目部、流通閱覽部、技術服務部、參考咨詢部、閱讀推廣部、醫學文獻檢索教研室等部門，校學報編輯部掛靠在圖書館，負責編輯出版《福建醫科大學學報》和《福建醫科大學學報（社會科學版）》。福建醫科大學圖書館，福建醫科大學圖書館始建于1937年，經過八十年人文與歷史的積淀，伴隨著學校的建設和發展，圖書館不斷完善基礎建設和服務工作，現代醫學文獻資源得天獨厚，已形成面向我校教學、科研和醫療等服務的現代化圖書館。
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