隨著國家對“京津冀協同發展”工作的推進，我院已與14家河北省醫療機構建立了技術合作關系。醫院對外合作醫療機構65家，涉及包括四川、青海、新疆、寧夏、內蒙古、云南、湖北、山西、山東、河南、河北以及京郊區縣等地區，其中，在北京地區對順義、延慶、平谷和懷柔四家中醫醫院進行托管。
中藥房常備中藥飲片近660種，諸多院內制劑來源于名老中醫及專家的驗方、秘方和科研成果，現有批準文號的院內制劑192種，北京中醫醫院官網其中中藥制劑164種，丸、散、膏、顆粒、膠囊、洗劑、酊劑、油劑等近20種劑型，70余種為臨床常用制劑。配備大型醫療設備近50種：如3.0T磁共振儀、256層極速CT、數字平板血管造影系統、SPECT/CT、超聲內鏡、雙板數字DR、心臟三維標測系統、全自動智能采血系統、全數字平板乳腺攝影系統、聚焦超聲腫瘤消融機、數字胃腸造影系統、彩色超聲診斷系統、術中CT、全自動生化分析儀等現代化醫療設備。病房煎藥室始終保留一人一方，直火砂鍋煎藥的傳統煎藥模式。醫院設立有6個醫技科室：放射科、核醫學科、病理科、醫學檢驗科（包含輸血科）、超聲診斷科、營養科。
醫院下設北京市中醫研究所、北京市中醫國際交流培訓中心、北京市趙炳南皮膚病研究中心等，是首都醫科大學中醫藥臨床醫學院、北京中醫藥大學教學醫院、北京市中醫住院醫師（全科醫生）規范化培訓基地。北京中醫醫院始建于1956年，首都醫科大學附屬北京中醫醫院首頁http://www.bjzhongyi.com，是北京市的一所市屬綜合性、現代化三級甲等中醫醫院，承擔著北京市中醫醫療、教學、科研、預防等任務。
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