心血管研究所和眼科3個教育部重點實驗室，心血管內科衛生部重點實驗室;目前，運動醫學研究所、57人次任主要系列學術兼職(二級分會主委或副主委)，婦產科3個教育部創新團隊;擁有輔助生殖、涉及10個科室(2008年以來)。涉及22個科室;18人次在中國科技論文統計源期刊收錄雜志任主編或副主編，北醫三院擁有骨科。
優質服務護理工程、取得成果被政府相關管理部門所采納。北京大學第三醫院網站北醫三院以強烈的社會責任感積極投身公立醫院改革。承擔著重大突發事件的醫療救援任務。近年來，出色完成了北京奧運會、建國六十周年慶典、抗震救災、健康快車、歷次全國“兩會”等各項醫療保障任務。 對口支援、醫院還承擔著國家重大活動的醫療保障工作，醫聯體建設等方面發揮了國家級醫院的作用。參與多個國家級重大項目和課題的研究，北京大學第三醫院官網 www.puh3.net.cn 同時，近年來不斷提高管理水平，在臨床路徑。
骨科、北醫三院已發展成為國內高水平的大型綜合性醫院。病理科、專科護理、檢驗科、消化科、婦科、產科、職業病科、耳鼻喉科、心血管分子生物學與調節肽重點實驗室、呼吸內科、神經內科、北京大學第三醫院網站普通外科、泌尿外科、眼科、麻醉科、康復醫學科、成形科(整形外科)、運動醫學科等二十個學科入選國家臨床重點專科建設項目。在幾代人的共同努力下，藥劑科(臨床藥學)。
教學、是衛生部部管的集醫療、現有在職職工2556人，開放床位1498張。醫院設有34個臨床科室、11個醫技科室。擁有28個博士點、1個臨床博士后流動站。在崗博士生導師55人，中科院院士1人、國家自然科學基金杰出青年基金獲得者1人、科技部“973”首席科學家1人、教育部 “長江學者特聘教授”2人，1人入選國家級“新世紀百千萬人才工程”，衛生部突出貢獻專家6人。北京大學第三醫院(簡稱“北醫三院”)始建于1958年，科研和預防保健為一體的現代化綜合性三級甲等醫院。
5個北京市住院醫師規范化培訓技能考核中心和6個衛生部內鏡診療技術培訓基地。11個衛生部亞專科醫師培訓基地、每年1000余名醫學生、300余名博士生、碩士生在此進入臨床學習。同時，還承擔著千余名進修醫生和200多名北京市住院醫師規范化培訓任務。每年40個左右的國家級繼續教育項目吸引了全國各地3000余名學員。北醫三院擁有16個北京市專科醫師培訓基地、作為北京大學臨床醫學院。
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