中期檢查等工作。在研究生后期培養過程中，2002年開始建立研究生管理信息系統。為保證學位授予質量，在學位授予方面，重點加強了開題。
博士研究生要在相關專業SCI收錄期刊以第一作者發表論文一篇�！笆濉逼陂g研究生的科學研究工作及其所發表的大量論文對安徽醫科大學科學研究事業的發展起到了積極的推動作用，研究生發表論文的要求進一步提高，對實現安徽醫科大學由教學型大學向教學研究型大學轉變做出了巨大貢獻。碩士研究生要在相關專業國家級核心期刊以第一作者發表論文一篇、 從2003年開始。
圍繞學�！白龃笞鰪姟钡哪繕耍不蔗t科大學研究生學院網站“十一五”期間，安徽醫科大學研究生學院樹立科學發展觀，在校黨委和行政的正確領導下，大力發展研究生教育，進一步加強學科、學位點建設，導師隊伍建設，研究生教育管理等各個方面工作;進一步協調研究生教育規模與質量提高之間的關系，堅持“以人為本”，以全面提高研究生培養質量作為研究生教育發展的終極目標，積極引導全體研究生、研究生導師及管理人員廣泛地參與研究生教育改革與發展的各個領域。
博士研究生在國家級核心期刊發表論文一篇。在論文發表要求方面，安徽醫科大學研究生學院官網 yjsxy.ahmu.edu.cn 自2001年開始要求碩士研究生在申請學位前必須以安徽醫科大學為第一作者單位在中國科技論文統計源期刊公開發表論文一篇、2000年以前授予學位沒有公開發表論文的要求。
另有港澳臺自費兼讀制研究生73人，截至2012年上半年，統招碩士生2728人。在校統招博士生179人、在職攻讀碩士專業學位研究生127人。共有博士生導師152人、碩士生導師近1300人。
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