下設14個職能科、人才科、組織一科、組織二科、組織三科、黨員教育中心、大學生村官管理科、旗直機關工委辦公室、非公經濟和社會組織黨工委辦公室和黨建辦秘書科。 核定領導職數2正4副。干部教育科、中共準格爾旗委組織部是旗委主管黨的組織和干部工作的主要職能部門，準格爾旗黨建網考核科、干部科、中心，干部監督科、室、分別為辦公室。
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