并成立中山醫科大學基礎醫學院。隨后廣東光華醫學院也并入華南醫學院。此后，全國院校調整，這個階段，華南醫學院相繼改名為廣州醫學院、在著名的醫學教育家柯麟的帶領下，中山醫學院建立了完善的現代醫學教育體系，擁有一批在國內外醫學界有較大影響力的大師和名家，中山大學中山醫學院網站教學、科研和醫療取得了較大的發展，成為中南地區最高醫學學府和衛生部屬的六所全國重點醫學院校之一。嶺南大學醫學院和中山大學醫學院合并成立華南醫學院，中山醫科大學，中山醫學院、1953年解放初。
秦光煜、陳心陶、在1960年代，而當時全國才有33位一級教授，可見當年中山醫學院的地位。現在北校區醫學圖書館二樓陳列著八位一級教授和柯麟院長的油畫像。林樹模、中山大學中山醫學院官網 zssom.sysu.edu.cn 被人稱為“八大金剛”，周壽愷、謝志光、鐘世藩八位國家一級教授，中山醫學院擁有梁伯強、陳耀真。
兩次受到毛澤東主席的接見。陳心陶教授在防治血吸蟲病方面做出了突出成就。
第三階段：2001年兩校合并至今(2001～現在)
2001年10月，恢復了綜合性大學辦醫學教育。并成立了中山大學中山醫學院，我院進入一個嶄新的發展階段。隨著全國高等醫學教育管理體制改革，原中山大學和中山醫科大學合并為新中山大學。
