1991年12月經衛生部批準，隸屬于國立上海醫學院，復旦大學附屬中山醫院是國家衛生和計劃生育委員會預算管理單位，后更名為中山醫院。解放后曾稱上海第一醫學院附屬中山醫院和上海醫科大學附屬中山醫院，2001年用現名。醫院開業于1937年，是復旦大學的附屬綜合性教學醫院。中山醫院網站成為上海市第一批三級甲等醫院。為紀念中國民主革命的先驅孫中山先生而命名為孫中山紀念醫院，是當時中國人管理的第一所大型綜合性醫院。
倡導“嚴謹、精湛的醫療技術和嚴格的科學管理，團結、求實、以嚴謹的醫療作風、中山醫院始終秉承“以病人為中心”的精神，努力為國內外病人提供更多更好的醫療服務。奉獻”的院訓。
腎臟和肺部疾病診治是醫院的重點和特色，診治水平始終處于國內領先地位。國家臨床重點專科18個：消化科、檢驗科、中山醫院官網 zs-hospital.sh.cn 麻醉科、心血管內科、內分泌科、胸外科、心臟大血管外科、臨床護理、中醫腦病科、呼吸內科、腎病科、普通外科、重癥醫學科、腫瘤科、醫學影像科、器官移植科、急診醫學科和神經內科。中山醫院網站心血管病和肝腫瘤為上海市臨床醫學中心(重中之重)。上海市心血管病研究所、復旦大學肝癌研究所、上海市影像醫學研究所、上海市呼吸病研究所、上海市中西醫結合康復研究所、上海市肝病研究所、上海市腎病與透析研究所、上海市臨床生物信息學研究所、復旦大學呼吸病研究所、復旦大學血管外科研究所、復旦大學普通外科研究所、復旦大學內鏡診療研究所、復旦大學核醫學研究所、復旦大學超聲醫學與工程研究所、復旦大學慢性代謝性疾病研究所也設在院內，成為醫院重要的研究機構。上海市的院內感染、超聲診斷、呼吸內科、心血管內科、胸心外科、普通外科、綜合醫院中醫藥工作、血液透析8個臨床質量控制中心也掛靠中山醫院。醫院每年承擔國家級、省部級重大科研項目近百項。近年獲國家級、教育部、國家衛生計生委和上海市科技成果獎百項。設有博士點18個，碩士點21個，博士后流動工作站1個。是國家住院醫師規范化培訓基地醫院，有衛生部專科醫師培訓試點基地19個，上海市專科醫師培訓基地28個，上海市住院醫師培訓基地15個。每年舉辦國家級繼續醫學教育學習班逾50期，招收進修醫生超過700名，為國家培養了許多高級醫學人才。綜合實力雄厚。醫院設有除兒科以外的所有科室、肝癌、心臟。
宗旨：
“以病人為中心”
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