新華書店總店成功申請注冊“新華書店”服務商標，牽頭籌備成立“中國書刊發行協會”“中國新華書店協會”，使“新華書店”商標及品牌無形資產得到了有效的法律保護和應用，為國家出版發行事業發展做出了新的貢獻。
1977年開始，新華書店總店根據中央部署，對經歷“文革”沖擊的全國新華書店開展恢復整頓工作，在企業管理、業務恢復、隊伍培訓、發行體制改革、制度建設、創辦全國書市(即現在的全國圖書博覽會)、制定全行業發展規劃等方面做了一系列工作，全國新華書店發行網點、事業規模、職工隊伍得到蓬勃發展。
2008年4月，總店傳統圖書批發業務歇業。總店歷經多次國家出版物發行體制改革，逐漸失去了出版物總發行總經銷的市場優勢地位，承擔總店圖書發行主營業務的新華出版物流通公司資金鏈和業務鏈斷裂。總店經歷了由全國新華書店系統的分散到集中，又由集中到分散的跌宕起伏之路，總店事業也隨之進入發展的低谷期。
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