164個專業可以招收碩士生。碩士學位授權，全校有碩士學位授予專業116個，文學歷史學、理學、工學和管理學等9個學科門類。除培養學術型研究生外，廈門大學有權授予工商管理、法律、公共管理和工程專業碩士學位，大力培養應用型、復合型的高層次專門人才，廈門大學研究生院網站截止2004年9月全校在學研究生9743多人，其中博士生1483人。學位授予專業分布在哲學、教育學、經濟學、10個一級學科博士、法學、博士學位授權專業39個，100個專業可以招收博士生。
有340人擔任博士生指導教師(含兼職博導)，據有關資料顯示，在編的教授有368人，薈萃著眾多的學者名流，570多人擔任碩士生指導教師。廈門大學研究生院官網 gs.xmu.edu.cn 副教授587多人，師資力量雄厚，經過遴選和聘任，兩院院士9人。廈門大學擁有較好的辦學條件。
金融學、學科建設是發展研究生教育的基礎。財政學、最近廈門大學的政治經濟學、統計學、高等教育學、國際法學、專門史、物理化學、分析化學、海洋化學、廈門大學研究生院網站海洋生物學、動物學和會計學等13個學科專業被評為國家重點學科。凝聚態物理和環境科學等10個學科被確定為省重點建設學科。經過校內體制改革，研究生院下設研究生培養與管理處和學位與學科建設處，負責學位和研究生教育的規劃和管理，全校學科建設方面的管理工作。
國家工程技術研究中心1個，學校設有140多個研究機構，國家工程實驗室1個，其中國家重點實驗室2個，科技部國際科技合作重點科研機構1個，教育部重點實驗室5個，教育部工程技術中心2個，教育部文科重點研究基地5個，福建省重點實驗室、中心6個，福建省高校重點實驗室、文科基地20個，廈門市工程技術研究中心4個。
積累了豐富的辦學經驗，88年來，止于至善”的校訓，學校秉承“自強不息，形成了鮮明的辦學特色，成為一所學科門類齊全、師資力量雄厚、居國內一流、在國際上有廣泛影響的綜合性大學。建校迄今，已先后為國家培養了15萬多名本科生和研究生，在廈大學習、工作過的兩院院士達60多人。
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