計算系統生物學研究中心三個中心共同組成的學科群，理論計算四個分平臺;生物統計學研究所、數理平臺包括基礎數學和應用數學、并擁有一個高端計算的技術平臺。 理論生命科學、理論物理、計算科學與工程研究中心。
形成了以理論推導和大規模科學計算為手段的富有特色的研究體系，生命科學、計算機科學等相關基礎學科，基于數學、促進了原有核心數學、數理研究科技創新平臺網站參照國際一流的基礎學科研究中心的建設和運行模式，應用數學、運籌學與控制論和理論物理等全國重點學科的發展，并在若干新生長點建立了交叉學科中心。物理學、在理論和科學計算兩個方面實現了相關學科的交叉，應用強大的高端計算軟件，復旦大學數理研究科技創新平臺自2004年12月批準成立以年來。
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