公司按照GSP要求建立了完善的組織架構，設置有質量管理部、行政信息部、業務部、儲運部、財務部等五個職能部門。制訂質量管理體系文件，文件符合GSP要求，具有一定的規范性、系統性和可操作性。通過計算機系統管理，做到每個藥品從購進、收貨、驗收、儲存、養護、配送、出庫復核、運輸等均能進行有效的控制和追蹤。
公司現有連鎖門店10家。公司注冊地址為惠州市小金口街道辦事處長湖街一巷9號3樓302號房，倉庫地址為惠州市惠城區小金口街道辦事處小金口居委會黃牛欄街8號一層自編101房、三層。
公司對所屬門店實行統一管理下，統一商號，統一質量管理體系，統一 藥品采購、統一物流配送、統一計算機管理系統，統一票據格式的“七統一”管理，從而保證了藥品質量。
惠州市寶芝堂大藥房連鎖有限公司成立于2004年04月19日，現有員工50人以內，其中執業藥師3名，藥師1名，具有藥學或相關專業專科或以上學歷者4人，其他專科或以上學歷者2人，高中學歷者1人。
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