縱向科研經費1.3億余元；深圳市兒童醫院官網，近五年發表SCI論文334篇，國家自然科學基金重點項目、廣東省自然科學基金項目、國家自然科學基金面上及青年項目、包括國家科技部“863”課題、國家衛生部衛生行業科研專項重大課題、醫院近年來承擔了各級各類重大科研課題項目200余項，影響因子（IF>5.0）論文58篇。牽頭、執筆及參與制定國際國內指南標準20余部，深圳市兒童醫院官網·首頁承辦全球學術會議第10屆世界兒科感染性疾病大會并發布由我院執筆的《中國兒童合理使用抗菌藥物行動計劃（2017-2020）》。深圳市科創委重點項目等。
醫院現有職工2345人，其中博士生導師9名，碩士導師121名、享受國務院特殊津貼者1人、享受深圳市政府津貼者2人、博士102人、碩士582人、高級職稱專業人才387人。現有學術團體主任及副主任委員18人、學組組長及副組長15人，常委27人、委員271人，中華醫學會、中華預防醫學會、中華口腔醫學會、深圳市兒童醫院官網，中華中醫藥學會各專業組委員76人。涵蓋外籍院士，C類，截至2021年12月份，引進培養了一批具有高學術影響力的學科帶頭人和學科骨干，Ⅱ類等。海外高層次人才B類、實用型人才Ⅰ類、醫院注重人才建設。
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