深圳市統計局主要職能包括:組織和協調全市統計工作、組織實施本市國民經濟核算制度、深圳市統計局官網,組織實施國家統一部署的人口/經濟/農業等重大國情國力普查、組織實施全市各行業統計調查等。負責深圳市內政府綜合統計的職能部門。
深圳市統計局設有辦公室、綜合協調處、政策法規處(執法稽查處)、國民經濟核算處、工業和能源統計處、投資和建筑業統計處、社會科技和新興產業統計處、貿易外經統計處、服務業統計處、機關黨委(人事處)等內部機構和統計數據管理中心、統計普查中心直屬機構。