下設招生辦公室、 學科建設辦公室)，綜合管理辦公室。上海理工大學研究生院(黨委研究生工作部、學生工作辦公室、學科建設辦公室、專業學位辦公室、質量評價辦公室、培養辦公室、學位辦公室。
立足教育內涵式發展，上海理工大學從1978年開始招收研究生，學校研究生培養始終圍繞質量主線，上海理工大學研究生信息網是全國首批經國務院學位委員會批準有權授予碩士學位的高等院校之一。不斷以高層次的學科建設推動高水平創新人才培養。
學校圍繞“社會需求”重構學科組織，形成了利于研究生創新性發展的培養環境和制度體系，在培養大批符合社會發展需要的高層次創新人才上收到明顯成效。獲得“全國百篇優秀博士學位論文”1篇，提名2篇，獲得上海市優秀博士學位論文11篇，上海市優秀碩士學位論文14篇。按照“卓越開放”理念改革培養要素，聚焦“競爭激勵”完善體制機制，近年來。
現已建設成為具有工、管、文、上海理工大學研究生信息網官網 yjsjw.usst.edu.cn 法等6大學科門類涵蓋26個一級學科的學科體系，具有4個博士后科研工作流動站，5個一級學科博士點，32個二級學科(含自設)博士點，22個一級學科碩士點，90個二級學科碩士點，8個碩士專業學位類別，其中工程碩士領域18個。在校研究生已達6900余人，其中博士生400余人。博士生導師120余名，碩士生導師近800名。理、經、經過多年努力。
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