1988年成立研究生部，1986年獲得碩士學位授予權，內蒙古工業大學創建于1951年，是全國學位與研究生教育學會理事單位、全國工科工作委員會委員單位。研究生管理機構源于1984年成立的內蒙古工學院研究生辦公室，在國家高等教育布局中具有重要作用和特殊區域定位。是新中國成立后在少數民族地區最早創立的一所工科性大學，內蒙古大學研究生院網站是自治區高校中較早成立的研究生工作管理的處級建制。2001年3月成立研究生處，2010年正式成立研究生院。2003年獲得博士學位授予權，內蒙古工業大學學位與研究生教育始于1984年。
國家發展和改革委員會批準的國家地方聯合工程研究中心1個，自治區級創新團隊17個。自治區級科研創新平臺共有41個，學校現有教育部省部重點實驗室1個。
我校學科水平和學術影響力在穩步提升。我校“化學工程與技術”評價結果為B-、在2017年教育部學位與研究生教育發展中心組織的第四輪全國學科評估中，“力學”“土木工程”和“建筑學”評價結果為C-，“材料科學與工程”和“動力工程及工程熱物理”評價結果為C。
碩士研究生達到4490人，近10年培養博士研究生217人，內蒙古大學研究生院官網 yjsch.imut.edu.cn 各類碩士研究生7228人。我校學位與研究生教育能力顯著提升，經過70年的積淀，在校博士、培養質量不斷提高。
學位辦公室、綜合辦公室、學位點建設與質量評估辦公室等5個科室，分別負責研究生招生、培養、學位、學科建設與質量管理以及學部等方面工作。2018年學校設立學科建設辦公室和學部辦公室，掛靠研究生院。 同時也是學校學科建設的管理和服務機構。內蒙古大學研究生院網站研究生院是我校研究生教育教學管理工作的職能部門，培養與學籍管理辦公室、目前研究生院設置招生辦公室。
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