打造真正的專病專治、專科細分的特色男性專科醫院。醫院遵循國際治療男性疾病最新醫療模式，南方男科醫院官網，分為：前列腺科室、男性性功能障礙科室、男性生殖器整形科室、泌尿感染科室及男性不育科室，率先將男科診療精細化，為中國最具影響力的專科特色醫院。
四川省阿壩州汶川一帶發生新中國成立以來破壞性最強、涉及范圍最廣、受災人數最多、救災難度最大的地震災害。在特大地震災害面前，南方男科醫院官網·首頁2008年5月12日14時28分，深圳南方醫院即中國人民解放軍總后勤部下屬醫院，救死扶傷、治病救人。接待信息后立即組建近40名醫護人員抵達受災中心。
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