學校被評為“全國教育系統(tǒng)抗震救災(zāi)先進集體”、占地1500余畝，省“依法治校”示范校、學校現(xiàn)有上街、校舍建筑面積40多萬平方米。省文明學校、省衛(wèi)生先進單位、省綠化模范單位和省級花園式單位等榮譽稱號。福建省黨建和思想政治工作先進高校、省計劃生育先進單位、臺江2個校區(qū)，省“校務(wù)公開”示范校。
基礎(chǔ)醫(yī)學院、護理學院、醫(yī)學技術(shù)與工程學院、福建醫(yī)科大學網(wǎng)站口腔醫(yī)學院、學校現(xiàn)有研究生院、外國語學院、藥學院、人文學院、公共衛(wèi)生學院、協(xié)和臨床醫(yī)學院、第一臨床醫(yī)學院、第二臨床醫(yī)學院、省立臨床醫(yī)學院、福總臨床醫(yī)學院、思想政治理論課教學研究部、體育教學研究部、福建醫(yī)科大學首頁 www.fjmu.edu.cn 海外教育學院、成人教育學院、繼續(xù)教育學院等20個學院(部);七年制臨床醫(yī)學、五年制臨床醫(yī)學、預(yù)防醫(yī)學、口腔醫(yī)學、醫(yī)學檢驗技術(shù)、麻醉學、護理學、醫(yī)學影像學、藥學、公共事業(yè)管理、社會工作、康復(fù)治療學、應(yīng)用心理學、福建醫(yī)科大學網(wǎng)站藥物制劑、英語、基礎(chǔ)醫(yī)學、臨床藥學、生物制藥、食品質(zhì)量與安全、醫(yī)學影像技術(shù)、衛(wèi)生檢驗與檢疫、醫(yī)學實驗技術(shù)、生物信息學、生物醫(yī)學工程、藥物分析等25個本科專業(yè);有基礎(chǔ)醫(yī)學和臨床醫(yī)學2個一級學科博士點、27個二級學科博士點，有一級學科碩士點8個、二級學科碩士點55個，碩士專業(yè)學位授權(quán)點6個。在校生23500多人，其中全日制的本科生13000多人、博士研究生240多人、碩士研究生2100多人，本科專業(yè)面向全國招生，并招收港澳臺僑生和外國留學生。此外，學校已形成了多學科、多層次的成人醫(yī)學教育辦學體系。臨床教學部。
博士人才培養(yǎng)體系和“勤奮、嚴謹、求實、創(chuàng)新”優(yōu)良校風，成為一所集教學、科研、醫(yī)療、預(yù)防和社會服務(wù)為一體的省屬醫(yī)科大學。2003年，被福建省人民政府確定為重點建設(shè)高校。經(jīng)過77年的建設(shè)發(fā)展，碩士、福建醫(yī)科大學創(chuàng)建于1937年，學校已形成學士。
附屬第三醫(yī)院正在建設(shè)中，同時在福建省設(shè)有省立臨床醫(yī)學院、福總臨床醫(yī)學院、附屬漳州市醫(yī)院、附屬泉州第一醫(yī)院、附屬三明第一醫(yī)院、附屬龍巖第一醫(yī)院、附屬傳染病醫(yī)院、附屬閩東醫(yī)院、附屬南平第一醫(yī)院、附屬福州第一醫(yī)院、附屬武警福建總隊醫(yī)院、附屬寧德市醫(yī)院等非直屬附屬醫(yī)院和臨床醫(yī)學院12所。此外，有臨床教學醫(yī)院32所，形成了比較完善的臨床教學與實踐教學基地網(wǎng)絡(luò)，有效保障了臨床實踐教學的需要。附屬第一醫(yī)院、附屬口腔醫(yī)院4所直屬附屬醫(yī)院，學校現(xiàn)有附屬協(xié)和醫(yī)院、附屬第二醫(yī)院。
省級臨床重點專科14個，省“211工程”重點學科2個，省特色重點學科4個，省級重點學科9個，國家中醫(yī)藥三級實驗室1個，教育部重點實驗室1個，省級重點實驗室4個，省部共建重點實驗室2個，省級工程研究中心1個，省工程技術(shù)研究中心1個，省中醫(yī)藥二級實驗室2個，省高校重點實驗室5個，省高校優(yōu)勢學科創(chuàng)新平臺(培育)1個，承擔著大量的科研任務(wù)，成果顯著。學校編輯出版的學術(shù)刊物《福建醫(yī)科大學學報》、《福建醫(yī)科大學學報(社科版)》、《中華高血壓雜志》和《心血管康復(fù)醫(yī)學雜志》等，面向國內(nèi)外公開發(fā)行。學校圖書館面積2.56萬平方米，圖書、資料266多萬冊，是福建省醫(yī)學圖書中心館。科研機構(gòu)87個，國家臨床重點專科10個，學校現(xiàn)有臨床醫(yī)學和基礎(chǔ)醫(yī)學2個博士后科研流動站，福建省國家重點學科培育建設(shè)學科1個。
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