研究機構都有廣泛的實質性合作，香港中文大學等多個大學簽署了學生交換協議;目前有25%左右的學生在本科階段被公派到境外進行學習和實習，哥倫比亞大學、已經與密歇根大學、與美國、俄羅斯、香港等國家和地區的國際一流大學、未來3年內，這個比例將增加到40%。 日本、學院是北航國際交流最活躍的單位之一，歐洲。
獲得了國內外同行的高度認可，北航生物與醫學工程學院是接軌國際、生物醫學工程學科就在教育部最新一輪學科評估中排名第六。在北航率先開展了國際評估;經過短短10年的發展，全國一流的生物醫學工程領域人才培養單位。
現任院長樊瑜波教授為中國生物醫學工程學會前理事長、北航生物與醫學工程學院網站世界生物力學理事、國家醫療器械創新聯盟副理事長、IFMBE執委、美國醫學生物工程院AIMBE會士;學院共有專任教師62人，95%以上具有博士學位，85%以上具有海外留學經歷;學術帶頭人中包括院士1名、“千人計劃”教授1名，長江學者1名，杰出青年基金獲得者2名，國際宇航科學院空間生命學部院士、通訊院士各1名;科技部創新團隊1個，國家自然科學基金創新團隊1個。世界華人生物工程協會WACBE主席。
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