地處新疆維吾爾自治區東北部，南與哈密市相連，地理坐標為東經 90° 19′～94°48′，東鄰伊吾縣，巴里坤哈薩克自治縣古稱蒲類，北部與蒙古國接壤 ，北緯 43°21′～45°5′，邊界線長 313.4千米 ，隸屬哈密地區，東西長 276.4千米，南北寬 180.6千米，總面積 38 445.3萬平方千米。西連木壘哈薩克自治縣 。
1個良種繁育場， 8鄉、其中哈薩克族 35 876人，2010年， 2個開發區、巴里坤縣政府網全縣總人口 102 564人，占全縣總人口的 1.47%;其他少數民族 677人，占全縣總人口的 0.66%。巴里坤鎮是縣委、縣人民政府所在地，是全縣的政治、經濟、文化中心。境內駐有新疆生產建設兵團紅山農場和伊吾馬場。占全縣總人口的 62.89%;蒙古族 1 505人，巴里坤縣域內有 4鎮、占全縣總人口的 34.98%;漢族 64 506人。
歷來為牧業基地。植被稀疏，巴里坤縣政府網官網 www.xjblk.gov.cn 海拔在1 000～2 000米之間的小盆地內，盆地的東南邊沿有三塘湖鄉，該鄉盛產優質哈密瓜。在盆地中蘊藏有大量的石油、天然氣、煤等礦藏。巴里坤盆地周邊尤其是南北邊，土地肥沃，巴里坤山和莫欽烏拉山的溪水流下，灌溉很方便，有良田萬頃，自古以來是發展農業的好地方，有哈密地區的“糧倉”之稱。盆地中部地下水豐富，為沼澤地，巴里坤縣政府網有100多萬公頃的草甸草場，是國家重點保護的濕地之一。夏季為優良的牧場，牧草豐美。 部分小盆地中有泉水溢出。
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