所畫分子結構式可通過剪貼,在中文Windows環境可直接輸入漢字,放入Word等for Windows軟件編輯的文件中,為其它應用軟件調用,如轉換為EPS文件,可被Word for Dos、Word Perfect for Dos or Wordperfect for Windows調用。還可利用其提供的程序轉換為其它多種圖形格式的文件。還提供了模擬三維分子結構的工具,Chem Windows不但可以畫二維分子結構。
ChemWindows